Ayer pusimos el título a nuestro trabajo

La reunión de ayer, fue de nuevo clarificadora… . Y es que ya hemos entrado en una fase en la que estamos descubriendo el significado de nuestros datos y su implicación en el mensaje que queremos dar… Y es que tras varios meses de conocernos hemos llegado a un par de gráficos que resumen nuestro trabajo.

Graficos que nos van a permitir ya definir el mensaje de nuestro trabajo , y definir nuestro título que decidimos que fuera:

“Effect of bacteriophages on the persistence of resistant soil bacteria”

¡Este va a ser nuestro norte!!!, explicar el significado de este título a través de nuestros resultados!!!!
Manos a la obra….
Ahora sí que tenemos cerca, ya casi hemos llegado a nuestro objetivo.
Aupa Equipo!!!

Pensando “científicamente”!!!!!

Vaya reunión la de ayer!!!! Fue online, pero tuvo su “enjundia”.
Nuestro investigador, nos propuso que analizáramos en detalle el resultado de nuestro último experimento.

Y… NO SE TRATABA SOLO DE CONTAR!!!!.
Nuestros datos nos deberían indicar el número y el “tipo” (azul y blanca) de bacterias presentes en cada uno de los cultivos.

 

De los datos se desprende un comportamiento distinto de las mezclas bacterianas dependiendo del fago al que se enfrentaban. Esto es especialmente claro en la mezcla denominada B, donde enfrentábamos la cepa conteniendo el sistema de defensa UG5, frente a otra idéntica pero que no lo contenía. (GR4UG5 versus GR4pTG2).

Los datos de este experimento nos van a poder permitir responder a la pregunta que nos hicimos al comienzo de este proyecto:

¿Son los virus, los que garantizan la diversidad presente en las bacterias?

Ya estamos mucho más cerca de nuestro final. Las próximas jornadas serán claves para lograrlo.
Ánimo equipo!!!!

Nuestros resultados!!!

Por fin nuestro Investigador nos ha resumido los últimos datos. Ahora nos queda interpretarlos y saber si de ellos podemos extraer conclusiones “aventuradas” o definitivas.  

Y es que lo que hay que hacer ahora es “contar”…. .

Necesitamos conocer el número de bacterias presentes en 1 ml de cada uno de os cultivos “problema” (A0 hasta B2)

Imagen 1: siempre tenemos que tener claro el experimento realizado y lo que pretendíamos demostrar.

Esos números nos servirán para decidir e interpretar qué ha pasado y cómo enfocar nuestra “historia”, nuestro trabajo, etc… y saber si de ellos podemos extraer conclusiones “aventuradas” o definitivas.

Por tanto hay que contar “todo” lo que pueda ser contado.

Imagen 2: Ejemplos de los distintos plaqueos hechos. El número obtenido nos servirá para inferir el número de bacterias presentes… 

Jóvenes!!! Contemos el nº de colonias presentes en las placas que permitan inferir el número de bacterias en cada cultivo. Tanto en experimentos con bolitas (100 ul y placa entera) como en experimentos con gota (5 ul). Debemos tb contar en la medida de lo posible cuantas colonias blancas y cuantas colonias azules hay en cada cultivo… .

En recursos tenéis de nuevo la presentación resumen de este último experimento, que deberíais completar con vuestros apuntes. Todos los datos de lo que hicimos van a ser necesarios para nuestros cálculos.

Finalmente, necesitamos rellenar una tabla de este tipo, para empezar a ver el fin de nuestro trabajo:

Esta tabla nos definirá la pregunta planteada al principio de esta entrada:

“Cúal es el número de bacterias presentes en 1 ml de cada uno de los cultivos (A0 hasta B2)” y cuantas son azules y cuantas blancas”

Cuando no siempre “sale” lo que se espera…

El pasado Jueves tuvimos un nuevo encuentro virtual, sospecho que no será el último. En él estuvimos valorando discutiendo, los resultados del último experimento.

Imagen 1: Ejemplo de una de las placas. Izquierda: en el IES, derecha en la EEZ.

Se trataba de evaluar el efecto de la presencia de fagos en la dinámica de crecimiento de un cultivo.

Sin embargo, no pudimos extraer grandes conclusiones tras la incubación de las distintas diluciones de los cultivos en las placas… Tan solo se apreciaron datos en las diluciones de los cultivos donde no se añadió ninguno de los fagos (Imagen 1). Todo se vio afectado por la presencia de diversos tipos de contaminantes

Ejemplos de contaminaciones que aparecieron en una de las placas.

Sin embargo, tras analizar en detalle algunas de las diluciones observamos que el experimento estaba bien planteado. Los datos de Absorbancia no engañaban y de alguna manera, aparecieron colonias y cultivos solo en aquellas placas donde deberían estar (ver en recursos un resumen del experimento llevado a cabo: Práctica IV).

Una nueva cita para confirmar esta tendencia la tenemos ahora sí en la EEZ, donde quizás estemos en condiciones más asépticas para obtener nuestros datos.

Y es que Ciencia, también es poner en valor la dificultad de obtener resultados concluyentes. Estamos en el camino.

Aupa Fagos team!!!!