Ya conocemos la EEZ!!!!

El pasado Martes 31 de Enero tuvimos una reunión muy especial. El equipo realizó unos ensayos utilizando los laboratorios del departamento de Microbiología de la EEZ-CSIC.

Primero, tuvimos una reunión en la que vinieron los padres de Laura y de Marta y nuestro investigador nos explicó donde nos encontrábamos y a donde queremos llegar con nuestro proyecto.

Imagen 1: El equipo (con los padres de Marta y Laura) en la tarde de ayer a la entrada del edificio de Microbiología donde tuvieron lugar los experimentos.

En recursos tenéis el pdf de esta presentación a la que asistieron también los padres de Marta y de Laura.

Pero, la parte importante de la tarde fue ponernos manos a la obra para entender qué es lo que vamos a analizar y cuál va a ser nuestro material de partida.

Basándonos en experimentos “clásicos” de microbiología y virus (fagos) queremos responder cuál es la dinámica de nuestro cultivo (de la bacteria S. meliloti) en presencia de distintos tipos de fagos muy concretos .

Confiamos en llegar a Gráficos de este tipo:

Imagen 2: Evolución de un cultivo de E coli durante 46 días publicado por Chao et al 1976. Paco, nuestro investigador piensa que podemos analizar nuestra cinética hasta 220 h donde se ve el efecto del fago en la lisis bacteriana. Claro que nuestro sistema es otra bacteria : S. meliloti.

Vamos a necesitar los siguientes Materiales:

Bacterias:

GR4 (UG5): resistente a algún fago

GR4 (vv): sensible a todos los fagos.

y Bacteriófagos:

3.2: es sensible a GR4 resistente

1.3: infecta a los dos aislados por igual…

Ayer entendimos la diferencia y el cómo obtener título de fagos frente al plaqueo de colonias resultado de nuestra primera práctica del Ayala.

Os recomiendo que le echéis un vistazo a vuestros apuntes y recordéis cómo se prepararon estas “placas tan especiales”.

Imagen 3: Momento importante de la tarde. Paula (dcha) y Cristina (izda) plaqueando las diluciones seriadas de fagos en condiciones de esterilidad. El resultado de nuestro test estará en 24-48 h. Una nueva sesión online nos espera para discutir los resultados.

Y es que fue un día muy intenso donde entendimos la información que aporta un espectrofotómetro, en concreto en su función Densidad Optica a 600 nm.

 Turbidez = cantidad de bacteria, siempre y cuando el cultivo no esté saturado (o sea D= inferior a 0,9).

Fue una jornada larga y extensa de la que se deriva una nueva reunión on line para discutir resultados….

Estamos citados el próximo Jueves 9 de Febrero a las 18:30…
El proyecto ya está en marcha!!!!!

Nuestra primera reunión ‘on line’

El pasado Martes 24 de Enero, reanudamos nuestro proyecto con una nueva reunión on line.

 Imagen 1: Participantes del proyecto a falta de Alba, que no pudo asistir.

Y es que este tipo de reuniones han venido para quedarse, tienen, la ventaja de la facilidad de reunión y discusión y es que en Pandemia las hemos usado mucho, verdad?? Pero algo me dice que las vamos a usar ya lo que queda de nuestra existencia, si es que no venimos usándolas ya desde mucho.

Y es que como siempre pasa en estos proyectos, había mucho que discutir, Por lo pronto, los resultados de nuestro primer experimento:

¿Cuantas bacterias tiene una colonia?

Imagen 2: Ejemplo de algunas de las diluciones realizadas en el laboratorio del IES F. Ayala. Estas eran de Alba y Cristina. (VAYA PEDAZO DE LABORATORIO!!!!)

Y es que, estuvimos analizando las distintas placas y entendiendo el porqué de algunos resultados de ellas: desde aquellas que no apareció ninguna colonia (probablemente porque se secaron en nuestra estufa del IES, hasta aquellas donde las diluciones tenían una coherencia y de las que fiarnos para dar un resultado plausible.

Todavía nos queda dar números del experimento en el que podamos responder a la pregunta de partida y a estas otras dos:

(ii) calcular el número de generaciones que han transcurrido para la formación de cada una de las colonias.

(iii) Teniendo en cuenta que se han formado en 24 h, calculad el tiempo de generación medio (cuánto tarda una bacteria en dividirse en dos hijas).

Estaría bien que las resolviéramos y pusiéramos los comentarios en este blog.

Y por último, en la reunión también hemos avanzado en hacia donde nos dirigimos en el proyecto (ver una nueva presentación en recursos, “el sistema UG5 y Sinorhizobium meliloti”.

¡¡¡¡Ya tenemos un norte de nuestra investigación y ya estamos preparados para abordarla!!!!!

Quedamos entonces pendientes de resolver las cuestiones planteadas (ponerlas en comentarios en el blog) y citados para el próximo Martes 31 Enero a las 17 horas en la Estación Experimental del Zaidín.

 

 

Insisto, Nos vamos a convertir en unos expertos en Microbiología…!!!!!

Dr Francisco Martinez-Abarca
Estacion Experimental del Zaidin - CSIC
Department of Microbiology
C/ Profesor Albareda n 1
18008 Granada
Spain